Atomix berlangsung di lapangan bermain yang terdiri dari sejumlah dinding, dengan atom-atom tersebar di seluruh.
Pemain bertugas merakit molekul dari atom. Atom harus diatur agar sama persis dengan molekul yang ditampilkan di sisi kiri layar.
Pemain dapat memilih atom dan memindahkannya ke salah satu dari empat arah mata angin. Sebuah atom yang bergerak terus meluncur ke satu arah hingga menabrak dinding atau atom lain.
Memecahkan teka-teki membutuhkan perencanaan strategis dalam memindahkan atom, dan pada level selanjutnya dengan sedikit ruang kosong, bahkan menemukan ruang untuk molekul yang sudah selesai bisa menjadi masalah. Setelah molekul dirakit, pemain diberi skor; semakin cepat teka-teki diselesaikan, semakin tinggi skornya.
Setiap teka-teki harus diselesaikan dalam batas waktu. Sebagian dari skor pemain dapat dihabiskan untuk memulai kembali teka-teki yang gagal. Seluruh permainan terdiri dari 30 teka-teki dengan kesulitan yang semakin meningkat.
Selain itu, setelah setiap lima teka-teki, ada level bonus di mana pemain harus memindahkan labu laboratorium berisi berbagai jumlah cairan untuk menyusunnya dari kosong menjadi penuh.
New Android ready!
